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高通量测序遗传病检测项目 推介会
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|地区:湖北
|类型:采购公告
基本信息
信息类型:采购公告
区域:湖北
源发布时间:2025-04-01
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我院拟开展高通量测序遗传病检测项目推介会,欢迎符合条件的供应商积极报名参与。
一、服务内容:
提高临床分子诊断水平
二、检测资质与经验要求:
(一)产前染色体cnv检测
1.检测内容:23对染色体非整倍体、100k以上的缺失重复、宫内目标病原感染检测;
2.检测方法:低深度全基因组高通量测序(cnv-seq);
3.样本类型:流产组织、绒毛、羊水、脐带血、外周血等;
4.报告周期:自采样起9天;
5.数据参数要求:平均有效数据量≥35m;单样本检测有效数据量要求≥20m reads;
6.资质要求:通过染色体基因组结构异常室间质量评价。检测设备获得nmpa认证。检测试剂盒及分析软件有注册证。
7.具有完善的质控流程及方案,检测过程从样本信息、样本检测前处理、检测、分析解读、报告、检测后等环节都有严格的质量控制点
8.具有cnv-seq智能化解读云平台,能提供智能化acmg打分、变异注释、自动出报告等cnv解读本地化方案。
(二)产前染色体cnv检测plus
1.检测内容:三倍体、23对染色体非整倍体、100k以上的缺失重复、目标区域单亲二体、宫内目标病原感染检测、母源污染检测;
2.检测方法:低深度全基因组高通量测序(cnv-seq),短串联重复序列检测(str),甲基化特异性qpcr(ms-qpcr);
3.样本类型:流产组织、绒毛、羊水、脐带血、外周血等;
4.报告周期:自采样起12天;
5.数据参数要求:平均有效数据量≥35m;单样本检测有效数据量要求≥20m reads;
6.资质要求:通过染色体基因组结构异常室间质量评价。检测设备获得nmpa认证。检测试剂盒及分析软件有注册证。
7.具有完善的质控流程及方案,检测过程从样本信息、样本检测前处理、检测、分析解读、报告、检测后等环节都有严格的质量控制点
8.具有cnv-seq智能化解读云平台,能提供智能化acmg打分、变异注释、自动出报告等cnv解读本地化方案。
(三)新生儿遗传病基因筛查
1.检测内容:新生儿相关遗传病,不少于240基因不少于240种遗传病。
2.检测方法:目标区域捕获和高通量测序技术。
3.报告周期:12个工作日。
4.样本类型:外周血、干血片
5.数据解读:
******学院(american college of medical genetics and genomics,acmg)及clingen相关指南。
(2)报告致病和疑似致病变异,报告范围需要包括dmd基因连续2个外显子及以上的缺失/重复,smn1基因7号外显子缺失,地中海贫血hba/hbb基因--sea、-α3.7、-α4.2、chinese、sea-hpfh、fil、thai大片段缺失)。
6.数据参数要求:
(1)测序数据量不小于0.6 g;
(2)fastq数据q20≥90%、q30≥85%;
(3)基因组比对率>; 99%;
(5)目标区域覆盖度≥99%、20x覆盖度≥95%;
(6)核基因组去重平均测序深度≥100x、线粒体去重平均测序深度≥300x
(7)捕获效率>;45%。
(8)对ngs分析流程中低质量的snv及cnv结果通过sanger测序、qpcr等方法进行二次验证。
7.资质要求:通过遗传病高通量测序检测生物信息学分析室间质量评价。检测设备获得nmpa认证。
(四)地中海贫血基因检测(508种)
检测内容:通过高通量测序方法,检测超过500种α和β地贫类型(涵盖α地贫缺失型、α地贫突变型、β地贫突变型和β地贫缺失型),同时能够检出α和β珠蛋白异常血红蛋白突变类型。
检测周期:15个工作日以内。
产品性能:投标人针对地贫的检测必须同时涵盖α地贫缺失型、α地贫突变型、β地贫突变型和β地贫缺失型及异常血红蛋白突变(提供详细检测列表);投标人针对地贫的检测范围应将hba1、hba2和hbb三个基因测通(含调控区、外显子和内含子);检测范围内的地贫类型准确率>;99%。
可检测样本类型:外周血、血斑、唾液和dna。
******医院的合作记录等)
样本运输:24小时之内收样本,公司自有物流体系。
检测配套资质:近三年参与全国地中海贫血基因分型室间质评,并合格通过;取得国家卫健委高通量基因测序技术遗传病诊断专业临床应用试点;
(五)单基因遗传病携带者筛查
检测内容:通过高通量捕获测序技术对常见的隐性单基因遗传病进行筛查
1)单基因遗传病携带者筛查(155种):
需覆盖包含sma、dmd、α及β地贫等常见遗传病在内的155种疾病,致病或疑似致病变异≥9000个,报告需提示剩余风险。
2)单基因遗传病携带者筛查(41种):需覆盖包含sma、dmd、α及β地贫等常见遗传病在内的41种疾病
3)单基因遗传病携带者筛查(10种):需覆盖包含sma、dmd在内的10种常见隐性遗传病
检测周期:15个工作日以内。
产品性能:与sanger测序法符合率>;99.9%以上,特异性>;99%。
可检测样本类型:外周血或dna。
******医院的合作记录等)
样本运输:24小时之内收样本,公司自有物流体系。
检测配套资质:具备医疗机构执业许可证、卫生部临检中心pcr实验室、高通量基因测序医学实验室通过iso 15189医学实验室管理体系与cap/ clia医学实验室认证、取得卫健委高通量基因测序技术遗传病诊断专业临床应用试点;
(六)癫痫用药指导基因检测
检测药物(不少于12种):奥卡西平、苯巴比妥、苯妥英、丙戊酸、布瓦西坦、卡马西平、拉考沙胺等。
检测基因(不少于10个):hla-b、hla-a、scn2a、cyp2c9、polg、cyp2c19等。
检测位点(不少于28个):hla-b*15:02/*51:01、rs******、rs******、rs******、rs******、rs******、rs******、rs******、rs******、rs******、rs******5、rs******7、rs762551等。
检测周期:10个工作日。
样本类型:多种样本类型可选,如全血、干血片、口腔拭子。
报告形式:报告中明确展示药物与基因及位点对应关系。需包含位点检测结果、药物用药建议及用药建议详细解读。每种药物的解读依据需在报告中列明。
准确率:位点分型与sanger测序法符合率99.9%以上。
服务:为保证项目检测后的服务质量,投标方需具备遗传咨询服务团队,能同时提供线上遗传咨询服务,需附上遗传咨询团队咨询经验介绍及在线咨询服务流程。并有专门客服团队承接检测咨询服务。
投标人个体化用药指导基因检测项目有充足临床经验(提供已完成检测例数材料)。
投标人资质:具有《医疗机构执业许可证》;通过当地省临床检验中心临床基因扩增检验实验室验收合格(提供验收合格证书复印件,原件备查);应通过医学检验实验室质量管理体系认证,获iso 9001、iso 14001、iso 15189、iso 17025质量管理体系审核认证;具有生物样本库和数据库,可为招标单位提供生物样本、基因数据的存储服务,为后续科研作支持。
(七)儿童个体化用药指导基因检测
检测药物(不少于130种):阿芬太尼、阿司匹林、氨基比林、布洛芬、丁丙诺啡、芬太尼、吗啡、哌替啶、喷他佐辛、羟考酮、曲马多、舒芬太尼、双氯芬、丙酸氟替卡松、布地奈德、沙丁胺醇、沙美特罗/氟替卡松、右美沙芬、阿米卡星、氨基水杨酸、吡嗪酰胺、达卡他韦、呋喃妥因、呋喃西林、呋喃唑酮、伏立康唑、复方磺胺甲噁唑等。
检测基因(不少于70个):cyp2c19、cyp2d6、cyp3a4、g6pd、oprm1、mt-rnr1、ptgs1、chia、gp1ba、ltc4s、adrb1、abcb1等。
检测位点(不少于120个):rs******、rs******7、rs******8、rs******9、rs******、rs******、rs6065、rs730012、rs******、rs******、rs******、rs******、rs******、rs******等。
检测周期:10个工作日.
样本类型:多种样本类型可选,如全血、干血片、口腔拭子。
报告形式:报告中明确展示药物与基因及位点对应关系。需包含位点检测结果、药物用药建议及用药建议详细解读。每种药物的解读依据需在报告中列明。
准确率:位点分型与sanger测序法符合率99.9%以上。
服务:为保证项目检测后的服务质量,投标方需具备遗传咨询服务团队,能同时提供线上遗传咨询服务,需附上遗传咨询团队咨询经验介绍及在线咨询服务流程。并有专门客服团队承接检测咨询服务。
投标人个体化用药指导基因检测项目有充足临床经验(提供已完成检测例数材料)。
投标人资质:具有《医疗机构执业许可证》;通过当地省临床检验中心临床基因扩增检验实验室验收合格(提供验收合格证书复印件,原件备查);应通过医学检验实验室质量管理体系认证,获iso 9001、iso 14001、iso 15189、iso 17025质量管理体系审核认证;具有生物样本库和数据库,可为招标单位提供生物样本、基因数据的存储服务,为后续科研作支持。
(八)遗传性耳聋基因检测(4基因20位点)
检测内容:通过高通量测序方法,检测4个常见耳聋基因(gjb2,slc26a4,mt-rnr1,gjb3),覆盖gjb2、gjb3、slc26a4及mt-rnr1这4个耳聋基因的常见位点数≥20个位点。
检测周期:10个工作日以内。
产品性能:准确率高,与sanger测序法符合率100%,特异性在99.9%以上,可检出杂合、纯合、复合杂合突变等位点。
可检测样本类型:全血、干血斑、dna。
******医院的合作记录等)
样本运输:24小时之内收样本,公司自有物流体系。
检测配套资质:检测设备、分析软件获得nmpa认证;具有生物样本库和数据库,可为招标单位提供生物样本、基因数据的存储服务,为后续科研作支撑
(九)遗传性耳聋基因检测(24基因208位点)
检测内容:通过高通量测序方法,检测耳聋基因≥20个,包含常见的gjb2、gjb3、slc26a4、mt-rnr1、otof及tmc1等;检测位点≥200位点。覆盖先天性聋、大前庭水管综合征、药物性聋、听神经病、尤赛氏综合征等耳聋疾病。
检测周期:10个工作日以内。
产品性能:与sanger测序法符合率>;99.9%,可检出杂合、纯合、复合杂合突变等位点。
可检测样本类型:全血、干血斑、dna。
******医院的合作记录等)
样本运输:24小时之内收样本,公司自有物流体系。
检测配套资质:检测设备、分析软件获得nmpa认证;具有生物样本库和数据库,可为招标单位提供生物样本、基因数据的存储服务,为后续科研作支撑
(十)遗传性耳聋基因检测(ngs panel 127基因)
1.基本需求
检测内容:综合征与非综合征型型耳聋相关基因检测,基因数不少于120个,包含线粒体上耳聋相关基因。可检出点突变、小片段缺失/插入突变等突变类型。检测结果需要使用“金标准”sanger测序进行验证,包含父母验证结果样本类型:外周血
检测技术:目标序列捕获+高通量测序技术。
检测周期:20个工作日。
样本运输:24小时之内收样本,公司自有物流体系
2.设备要求:设备获得nmpa认证
(十一)胎儿显性单基因病无创产前筛查
1.检测内容:针对孕妇外周血中的胎儿游离dna,检测不少于150个显性单基因遗传病相关基因,关联疾病不少于200种;
2.检测方法:分子标签建库、目标区域捕获-高通量测序技术,检测目标基因的编码区及其上下游30bp范围;
3.报告周期:15个工作日;
4.样本类型:孕妇外周血;
5.数据参数要求:单个样本测序数据量>18g,有效数据量>100m reads,检测范围内>;99%的区域测序深度>500x,平均测序深度≥800x
6.资质要求:检测设备获得nmpa认证;
(十二)nipt plus胎儿染色体异常产前基因检测
1.检测内容:21-三体综合征、18-三体综合征和13-三体综合征、性染色体异常在内的所有染色体非整倍体异常,不少于88种临床明确的染色体缺失重复综合征。
2.检测质量要求:每个样品不少于25m reads。无创产前胎儿染色体非整倍体检测,21三体综合征检出率应不低于99%,18三体综合征检出率应不低于97%,13三体综合征检出率应不低于90%;复合假阳性率应不高于0.5%
3.报告周期:10个工作日
4.样本类型:孕妇外周血
5.资质要求:基因测序仪、分析软件、检测试剂盒具备nmpa批准可用于临床检测。近四年参与全国外周血胎儿染色体非整倍体(t21、t18、t13)高通量基因检测室间质评,并合格通过
6.其他要求:需为受检人群购买保险,阳性报销:21、18、13三体,其他染色体异常,双胎保额增加;假阴报销:包含除21、18、13三体之外的其他染色体数目异常和缺失重复综合征、出生后检测结果假阴性赔付不低于40万、出生前检测结果假阴性不低于2万。
(十三)全基因组测序wgs
1.检测内容:一次性检测人类基因组中2万多个基因,可分析的变异包括:核基因编码及非编码区(包括外显子、内含子区,启动子区和基因间区域等)的点突变(snv)、小片段插入缺失(indel),外显子水平的拷贝数变异(exoncnv),基因组大片段拷贝数变异(large cnv)及线粒体变异等,并可提示染色体纯合区域(roh)、易位倒位等结构变异(sv)、部分动态突变等。
2.检测方法:高通量测序技术。
3.可检测标本类型:外周血,基因组dna,羊水等。
4.报告周期:30天。
5.检测资质与经验要求:通过遗传病高通量测序检测生物信息学分析室间质量评价(提供近三年证书)。检测设备获得nmpa认证。既往已完成的高通量测序项目不少于20万例。
6.测序质量要求:去重测序深度>40x,20x覆盖度≥90%,线粒体200x覆盖度≥99%且线粒体拷贝数≥50。
******学院(acmg)相关指南,报告中致病位点给出明确的致病性评级证据项。数据库(clinvar, omim, gnomad,hgmd,dbsnp等)更新及时。
8.其他服务要求
(1)所有测序和数据分析过程,招标方可以实时知情,全程参与。
(2)所有测序原始数据定期提供给招标方。
(3)免费向招标方提供项目相关的技术培训服务,定期开展遗传咨询讨论会议,帮助招标方遗传咨询相关人才培养工作。
(4)向招标方提供测序数据深度挖掘的科研服务。
(5)为招标方配置本地化遗传数据分析/存储设施及数据库。
三、提交纸质文件的组成及要求
1、提供上述第二条要求的相关文件复印件。
2、在文件首页注明报名单位名称、联系人及联系电话;
3、每页资料必须加盖公章。
四、提交电子版资料
1、将word版明细表(公司名称、资质证照等)******
2、温馨提醒:纸质文件和电子版资料都在规定时间内提交才算报名成功。
五、其他
1、报名时间:2025年4月1日-4月7日(工作日)
******医院医务部老妇幼楼五楼
3、会议时间:具体时间另行通知。
4、联系人:蔡老师联系电话:027-******
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快照:2025-04-02
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